北京儿童医院

出生缺陷遗传学研究室开发从血液基因表达图谱预测其它组织表达谱的预测模型B-GEX
2020-07-27 08:27:09
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论文题目:Blood-based multi-tissue gene expression inference with Bayesian ridge regression

发表杂志:Bioinformatics


我院北京市儿科研究所出生缺陷遗传学研究室李巍教授团队提出一种能规避体内组织取样的组织细胞特异性表达谱分析的新方法,成功开发了生物信息学预测模型B-GEX,该模型可以基于血液全基因表达谱预测其它组织中部分基因表达量信息。借助公共转录组数据进行组织可预测性和靶基因可预测性评估,发现B-GEX能相对可靠地预测肝脏、肺等16个组织中的20%~60%的基因表达量情况。本项成果立足临床科研实际问题,有助于更全面的寻找临床样本中异常表达基因,具有重要的潜在应用价值。

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